INFORMACJA DLA AUTORÓW

      Postępy Mikrobiologii zamieszczają artykuły przeglądowe ze wszystkich dziedzin mikrobiologii nie drukowane w innych czasopismach oraz w dziale Nowości Wydawniczych recenzje nowych książek z zakresu mikrobiologii i nauk pokrewnych, które ukazują się w Polsce. Artykuły drukowane w Postępach Mikrobiologii nie mogą być bez zgody Redakcji publikowane w innych periodykach.
     Uprzejmie informujemy PT Autorów PM, że zgodnie z decyzją Zarządu Głównego Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów z dnia 6 lutego 2007 roku nastąpi zmiana w zasadach przyjmowania prac do druku w naszym piśmie. Autorzy manuskryptów proszeni są (od zeszytu numer 1/2008) o wnoszenie opłat (za każdy artykuł 250 PLN +23% VAT) na konto Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów: Bank Pekao S.A. 18 1240 5992 1111 0000 4774 7434.
     Otrzymanie przez Redakcję pracy wraz z kopią potwierdzenia wpłaty jest warunkiem uruchomienia procedury wydawniczej. Do dowodu wpłaty należy dołączyć (na osobnej kartce) informacje zawierające tytuł pracy, nazwisko autora korespondencyjnego oraz dane do wystawienia faktury VAT (NIP, adres instytucji lub osoby fizycznej).
      W przypadku niedopuszczenia pracy do druku zwrot opłaty dokonany będzie przez księgowość PTM

Redakcja

1. Sposób przygotowania manuskryptu.

      Prace należy przysyłać do Sekretariatu Redakcji w postaci elektronicznego zapisu tekstu w edytorze Microsoft Word dowolnej edycji w wersji PL na dyskietkach komputerowych (3,5” 1,44 MB). Do dyskietki powinny być dołączone 2egz. tekstu artykułu całkowicie zgodnego z zapisem elektronicznym. Objętość pracy nie powinna przekraczać wraz z piśmiennictwem i ilustracjami 30 stron maszynopisu. Maszynopis powinien być jednostronny (wielkość czcionki 12, odstęp pomiędzy wierszami 1,5), z numeracją stron. Po tytułach wydzielonych nie należy stawiać kropek.
     Na oddzielnej stronie (strona tytułowa) należy podać tytuł pracy, pod nim wpełnym brzmieniu imiona i nazwiska autorów, spis treści (tytuły poszczególnych rozdziałów) oraz kilka (nie więcej jak pięć) słów kluczowych (keywords). Tytuł pracy i spis treści należy powtórzyć w języku angielskim. Słowa kluczowe mogą bądź nie pojawiać się w tytule pracy - należy je podać w porządku alfabetycznym. Praca powinna kończyć się krótkim podsumowaniem, zawierającym najistotniejsze elementy treści. Na oddzielnej stronie należy dołączyć krótkie streszczenie pracy w języku angielskim (maksymalnie 250 słów). Tekst pracy powinien być zgodny z zaleceniami szczegółowymi Redakcji.
     Przesłane do redakcji prace winny być napisane poprawną polszczyzną. Redakcja rekomenduje P.T. Autorom Słownik Poprawnej Polszczyzny (red.Witold Doroszewski, Halina Kurkowska, Wydawnictwo Naukowe PWN. Warszawa,1998) jako pomoc w redagowaniu tekstu. Jakkolwiek Postępy Mikrobiologii są polsko-języczne, nie wyklucza się druku prac, napisanych po angielsku.

      Tabele i rysunki (po dwa egz., o rozmiarze nie przekraczającym 26,5 cm x 18 cm) winny być wykonane starannie (dokładne krycie) czarnym tuszem na kalce technicznej lub w formie wydruku z drukarki laserowej lub atramentowej. Fotografie (po dwa egz.) należy sporządzać na błyszczącym papierze, najlepiej w formacie 13 cm x 18 cm. Materiały te należy załączyć oddzielnie. Nie należy pozostawiać w maszynopisach wolnych miejsc na rysunki i zdjęcia, a tylko na kopii zaznaczyć miejsce, w którym powinny być umieszczone, np. tab. 1, rys. 1. Liczbę rysunków i tabel należy ograniczyć do istotnie niezbędnej ilości. Te same wskazówki odnoszą się do pojedynczych wzorów chemicznych. Każda tabela powinna być oznaczona kolejnym numerem rzymskim oraz mieć nagłówek opisujący jej treść. Na osobnej kartce należy załączyć spis z objaśnieniami jakie powinny się znaleźć pod rysunkami lub z uwagą “objaśnienia w tekście”. Podpisy pod wykresami, rysunkami, zdjęciami należy umieścić na osobnej stronie

      Cytowaną literaturę (Piśmiennictwo) należy wpisać oddzielnie jako ostatnie strony maszynopisu, wymieniając pozycje w kolejności alfabetycznej. W wykazie powinny być podane kolejno: liczba porządkowa, nazwisko autora, pierwsze litery imion, nazwiska współautorów pracy i pierwsze litery ich imion (w kolejności podanej w cytowanej pracy), pełny tytuł cytowanej pracy, skrócony tytuł czasopisma, tom, strona, i rok wydania (w nawiasach).
      Dla cytowanych wydawnictw nieperiodycznych należy podać kolejno: nazwisko i pierwsze litery imion autora, lub współautorów, tytuł dzieła, wydawnictwo, miejsce i rok wydania. W przypadku odwoływania się do artykułu w pracy zbiorowej należy dodatkowo podać tytuł tej pracy oraz nazwisko jej redaktora, wydawnictwo, miejsce wydania, rok, tom oraz na końcu stronę, np.

Portnoy D. A., Sun A. N., Bielecki J. E., Escape from the phagosome and cell-to-cell spread of Listeria monocytogenes (w) Microbial Adhesion and Invasion, red. M. Hook, L. Świtalski, Springer Verlag, New York, 1991, s. 86.

W przypadku gdy liczba współautorów pracy przekracza 10, należy podać nazwiska i inicjały pierwszego oraz ostatniego współautora a następnie dodać uwagę i wsp. np.

Tomb J.F., J.C. Venter i wsp.: The complete genome sequence of the gastric pathogen Helicobacter pylori. Nature 338, 539-543 (1997)

(wyżej cytowana praca jest dziełem 42 autorów)

       Powoływanie się w tekście na pozycje cytowanej literatury następuje przez wymienienie liczby porządkowej w nawiasach np. (10). Ilość cytowań w piśmiennictwie nie może przekraczać 100 pozycji.

      Warunkiem koniecznym przy użyciu informacji ze strony internetowej jest sprawdzenie i aktualizacja zapisu informacyjnego na stronie WEB w dniu wysyłania maszynopisu. W przypadku niewłaściwego adresu i niemożliwości odtworzenia informacji z sieci komputerowej, prace będą zwracane autorom. Cytowanie informacji publikowanej na stronach sieci internetowej powinno wyglądać następująco:

14. XYZ Website 14 listopada 1999 roku (online). Nazwisko wydawcy, jeśli jest znane, http://cbx.iou.pgr. (10 Października 1999 roku, data ostatniego sprawdzenia adresu). Cytowanie książek powinno zawierać szczegółowe dane o wydawnictwie. Cytacje prac oryginalnych przesyłanych poprzez sieć komputerową powinna zawierać następujące dane:

Nazwisko autora, inicjały imion, data przyjęcia pracy, tytuł pracy. Nazwa czasopisma, numer : strony (jeśli są dostępne) (online), adres internetowy, data potwierdzenia ważności adresu.

      Szczegółowe informacje dotyczące prawidłowego zapisu ilustracji znajdują się na stronie internetowej CADMUS (zobacz). Rysunki powinny być zachowane w pliku TIFF lub PSD. Grafiki kolorowe należy zachowywać w formacie CMYK. Dane są przyjmowane na standardowych mediach takich jak dyskietki 3,5 cala, CD-ROM lub DVD. Przesłane dyski lub dyskietki nie będą zwracane autorom. Zalecana przez redakcję kompresja informacji to ZIP. Minimalna rozdzielczość stosowana w ilustracjach powinna wynosić  300 dpi dla zdjęć szarych i kolorowych, 600 dpi dla liter i 1200 dpi dla linii w wykresach. Wszystkie grafiki należy przesyłać w 100% wymiarze bez konieczności skalowania. W celu szczegółowej informacji proszę wysyłać zapytanie przez e-mail na adres jbielecki@biol.uw.edu.pl.

      W przypadku reprodukcji w pracy cudzych rysunków lub tabel - nawet w formie zmodyfikowanej - bądź cytowania fragmentów cudzego tekstu, Autorzy Postępów Mikrobiologii przed przysłaniem tych materiałów do Redakcji są zobowiązani do uzyskania pisemnej zgody od Autorów oryginalnych prac i Wydawnictwa (z której materiały te pochodzą) na ich reprodukcję.
      Cytowany tekst powinien być wyraźnie oznaczony w odpowiednim miejscu manuskryptu, zaś u dołu strony powinna być zamieszczona informacja dotycząca pochodzenia cytatu oraz uzyskanej zgody na przedruk.
      Zaświadczenia wraz z informacją którego rysunku, tabeli lub cytatu dotyczą, należy przesłać wraz z manuskryptem przeznaczonej do publikacji pracy.       Uprzejmie zawiadamiamy, iż od 3-ciego zeszytu PM (2001 r.) Autorów naszego Pisma obowiązuje składanie wraz z manuskryptem:
- oświadczenia o oryginalności pracy. (Pobierz wzór oświadczenia)
- oświadczenia dotyczącego praw autorskich. (Pobierz wzór oświadczenia).

      Należy stosować dwuczłonowe nazwy zawierające nazwę rodzajową oraz gatunkową (np. Escherichia coli). Nazwy rodzajowe mogą być użyte same tj. bez nazwy gatunkowej, natomiast nie można użyć samych tylko nazw gatunkowych. Gdy w pracy podaje się pierwszy raz nazwę gatunku, musi ona składać się z pełnych wyrazów, przy ponownym użyciu tej nazwy, podaje się tylko pierwszą literę nazwy rodzajowej (zawsze dużą ) oraz nazwę gatunkową w pełnym brzmieniu np. E. coli. Nazwy gatunku, rodziny, rzędu, klasy, działu oraz królestwa należy pisać kursywą. Informacje szczegółowe dotyczące pisowni oraz prawidłowego nazewnictwa (zgodnego z wymogami współczesnej systematyki ) - przyjęte przez Redakcję Postępów Mikrobiologii, za instrukcją ASM - można znaleźć w Instructions to Authors, J. Bacteriol. Jan. 1999.

      Zgodnie z propozycjami WHO — Collaborating Centre for Reference and Research on Salmonella ("Antigenic Formulas of the Salmonella Serovars" M.Y. Popoff and L. Le Minor, WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Salmonella, Institut Pasteur, Paris, France, 1997) and "Identification and Serotyping of Salmonella and an Update of the Kaufmann-White Scheme" (A. C. McWhorter-Murlin and F. W. Hickman-Brenner, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Ga.) do rodzaju Salmonella należą tylko dwa gatunki tj. S. enterica i S. bongori — pierwszy z nich podzielony został na 6 podgatunków. Stosowane dotychczas zwyczajowe nazwy, nie posiadające statusu taksonomicznego, takie jak serotyp, typ serologiczny, zostały zastąpione nazwą serowaru (w oryginale serovar, sv.). Nazwę serowaru należy pisać dużą literą oraz prostym pismem (np. Typhi, Paratyphi B, Typhimurium itp.). Zgodnie z powyższym, nazwę pierwszego podgatunku rodzaju Salmonella można zapisać: S. enterica subsp. enterica sv. Typhimurium lub Salmonella subsp. I. sv. Typhimurium, bądź po prostu, Salmonella Typhimurium.

      Właściwości genetyczne szczepu opisywane są w terminach fenotypu oraz genotypu. Fenotyp opisuje obserwowane właściwości organizmu. Genotyp określa genetyczną strukturę organizmu, zwykle odnosi się do szczepu dzikiego. W/w określenia są bliżej objaśnione w pracy Demerec i wsp. Genetics 54 61:76,1966.

(a) Fenotypowe określenie właściwości organizmu stosuje się gdy zmutowane loci nie zostały zidentyfikowane oraz zmapowane. Może być także użyte w przypadku, gdy identyfikuje się produkt genu np. białko OmpA. Zapis fenotypu zasadniczo składa się z trzech liter, nie można ich pisać kursywą, pierwsza litera powinna być zawsze dużą literą. Preferuje się użycie liczb rzymskich lub arabskich dla oznaczania bliźniaczych fenotypów np. Pol1, Pol2, Pol3 itd. Typ dziki można zapisać dodatkowym oznaczeniem plus (Pol⁺); w odróżnieniu do tego oznaczenie minus określać będzie fenotyp mutanta (Pol^-). Czasami pewne charakterystyczne właściwości organizmu można zapisać używając liter np. (Str^S ).

(b) Genotypowe oznaczenia są podobne do fenotypowych - w obu przypadkach stosuje się zestaw trzech liter; genotyp pisze się zawsze małymi literami oraz kursywą (np. ara, his, rps.). Promotor, terminator oraz operator oznacza się literami p, t oraz o (np. lacZp, lacZt, lacZo;. Bachman i Low; Microbiol. Rev. 44,1-56, 1980).

(c) Typ dziki alleli można zaznaczyć wpisując dodatkowe oznaczenie plus nad oznaczeniem genu np. ara⁺, his⁺, nie oznacza się natomiast zmutowaych alleli znakiem minus.

(d) Miejsca mutacji oznacza się poprzez wstawiania liczby kolejnych izolacji (liczby alleli) po symbolu zmutowanego locus (np. araA1, araA2 itp.). W przypadku, gdy tylko jedno takie locus istnieje, lub gdy nie wiadomo w którym kolejnym locus mutacja powstała - po oznaczeniu genu wstawia się myślnik w miejscu dużej litery oznaczającej locus , zaś dalej podaje się liczbę izolacji ( np. ara-23).

(e) Zapis genotypu może być wzbogacony innymi oznaczeniami jak plus, dla typu dzikiego czy minus dla mutanta - można wprowadzić oznaczenia określające mutacje jak np. mutacja Amber (Am), mutant termowrażliwy (Ts), mutant konstytutywny (Con), mutant wrażliwy na niskie temperatury (Cs), białko hybrydowe (Hyb) np. araA230(Am), his D21(Ts). Wprowadzanie innych wzbogaceń powinno być poprzedzone w tekście odpowiednim wyjaśnieniem.

(f) Dodatkowe oznaczenia mogą też być użyte w przypadku konieczności rozróżnienia tego samego genu znajdującego się w różnych organizmach lub szczepach tego samego gatunku np. his_E.coli lub his_K-12 . Dodatkowe oznaczenia stosuje się również dla rozróżnienia pomiędzy genetycznymi elementami o tej samej nazwie np. promotory operonu gln; glnA₁ i glnA₂.

(g) Delecję oznacza się symbolem ,D usytuowanym przed zdelecjonowanym genem lub regionem np. D trpA432, D (aroP-aceE)419, lub D his(dhuA hisJ hisQ)1256. Fuzję genów ara i lac można przedstawić w ten sam sposób - F (ara-lac)1256. Podobnie F (araB’ -lacZ⁺)(Hyb) oznacza, że fuzja nastąpiła pomiędzy genami araB a lacZ. Inwersja jest oznaczana następująco IN (rrnD-rrnE)1. Insercję genu his E. coli do plazmidu pSC101 w pozycji 0 zasad (0kb) zapisuje się następująco pSC101 W (Okb::K-12hisB)4.

      Oznaczenie obecności episomu polega na podaniu jego symboli w nawiasie po nazwie szczepu rodzicielskiego np. W3110/F’ 8(gal⁺).

      Nie wymagają dodatkowych wyjaśnień skróty nazw, takich jak:

• nazwy miar i wag regulowanych przez Systeme International dc Unites (SI), ogólnie akcetowane jednostki takie jak bp, kb, Da, masa cząst., m. cząst.
• skróty nazw chemicznych takich jak: DNA, cDNA, RNA, cRNA, RNaza, DNaza, rRNA, mRNA, tRNA; AMP, ADP, ATP, dATP,ddATP, GTP itp.,
• ATPaza, dGTPaza itp. NAD⁺,NADH, NADPH, NADP⁺, poly(A), poly(dT) itp.,
• DEAE, EDTA, HEPES
• nazwy powszechnie stosowanych technik biologii molekularnej np. PCR, SDS-PAGE, nazwy ogólnie znanych linii komórkowych np. HeLa, J774
• nazwy jednostek biologicznych; PFU ( jednostka formowania łysinek), CFU (jednostka formowania kolonii), MIC ( minimalne stężenia hamujące wzrost), itp.

     Nowe zasady kształtowania nomenklatury endonukleaz restrykcyjnych oraz metylotransferaz zostały opublikowane w Nucleic Acids Research 2003, 31: 1805-1812. Przy pisaniu prac prosimy o korzystanie z zawartych tam informacji.

      Standardowe jednostki metryczne są stosowane dla określania długości, wagi i objętości. W przypadku przedstawiania tych wartości oraz molarności należy stosować przedrostki m, µ , n oraz p dla wartości 10^-3, 10^-6, 10^-9 oraz 10^-12. Temperaturę należy przedstawiać tylko w stopniach Celsjusza np. 37^oC.

      Jeśli wyznakowana jest pojedyncza cząsteczka w związku chemicznym należy nazwę tego związku zapisać w następujący sposób ¹⁴CO₂ , ³H₂O, H₂³⁵SO₄. Taki sam sposób zapisu stosuje się gdy radioaktywna cząsteczka nie występuje w naturalnej formie wyznakowanego związku np. ³²S-ATP lub gdy symbol izotopu związany jest z niespecyficzną nazwą związku np. ¹⁴C aminokwasy, ³H-liganty itp.
      W przypadku niektórych specyficznych związków chemicznych można stosować nawiasy kwadratowe obejmujące symbole radioaktywnej cząsteczki przed nazwą chemiczną związku np. [¹⁴C] mocznik, L-[metylo-¹⁴C] metionina, [g ^-32P] ATP.

3.6.Informacja dotycząca prac drukowanych w dziale publikacje metodyczne i standardy
      W dziale zatytułowanym PUBLIKACJE METODYCZNE I STANDARDY publikowane będą artykuły przeglądowe o charakterze metodycznym, reprezentujące dowolną dziedzinę mikrobiologii. Redakcja Postępów Mikrobiologii (PM), w porozumieniu z Zarządem Głównym PTM ustaliła, iż drukowanych będzie rocznie nie więcej niż cztery artykuły tej kategorii. 
      Redaktorem odpowiedzialnym za wartość merytoryczną, redakcję tekstu oraz ostateczne przyjęcie pracy do druku jest prof. dr hab. Stefania Giedrys-Kalemba. (adres: prof.dr hab. Stefania Giedrys-Kalemba – Katedra i Zakład Mikrobiologii i Immunologii Pomorskiej Akademii Medycznej. Al. Powstańców Wlkp. 72, 70-111 Szczecin, tel/fax (091)46 616 51, 52, fax (091)46 616 59, e-mail: kalemba@mp.pl lub kalemba@sci.pam.szczecin.pl
      Prace metodyczne przeznaczone do druku podlegają ocenie dokonywanej przez stałych Recenzentów lub Ekspertów powoływanych każdorazowo przez Redaktora działu.  Lista stałych Recenzentów patrz pkt.5. 
       Strona tytułowa każdego artykułu zaopatrzona będzie w informacje, iż praca należy do PUBLIKACJI METODYCZNYCH I STANDARDÓW oraz każdorazowo podana będzie data otrzymania od Autorów manuskryptu jak i data zaakceptowania go do druku.

• Objętość pracy nie może przekraczać wraz z piśmiennictwem i ilustracjami 20 stron maszynopisu.

• Liczba cytowań w rozdziale Piśmiennictwo nie powinna przekraczać 50 pozycji.

• W spisie cytowanego piśmiennictwa należy umieszczać wyłącznie prace drukowane w czasopismach naukowych, niedopuszczalne jest zamieszczanie danych bibliograficznych prospektów reklamowych lub promocyjnych firm farmaceutycznych.

3. Prawa autorskie:
      Do każdej przygotowanej do druku publikacji załączyć Oświadczenie dotyczące konfliktu interesów [pobierz wzór oświadczenia]

4. Zalecenia i uwagi dodatkowe:
      W celu uniknięcia kryptoreklamy, proszę o zwrócenie szczególnej uwagi na sposób przedstawienia czytelnikom produktów komercyjnych lub metod opracowanych przez producentów. Autorzy są również zobowiązani do ujawnienia (jeżeli takie istnieją) wszelkich powiązań (honoraria, granty, płatne ekspertyzy lub inne formy uzyskiwania korzyści osobistych) między Autorami a firmą, której produkt ma istotne znaczenie w nadesłanej pracy. W tym celu każdy z Autorów proszony jest o złożenie Deklaracji dotyczącej „konfliktu interesów”. Konflikt interesów występuje, kiedy Autor lub zakład pracy Autora ma finansowe lub osobiste związki z innymi osobami lub instytucjami, które mogą wpływać na jego działania i&;nbspdecyzje. Wzór deklaracji można pobrać ze strony internetowej PM. 
      Redakcja PM zastrzega sobie prawo ostatecznej decyzji o akceptacji pracy przeznaczonej do druku w dziale PUBLIKACJE METODYCZNE I STANDARDY. 
      Wszelkie proponowane zmiany w INFORMACJI DLA AUTORÓW P.M. zostaną przedstawione PT Czytelnikom Postępów Mikrobiologii przed ich wprowadzeniem.

5. Stali recenzenci działu PUBLIKACJE METODYCZNE I STANDARDY: 
Danuta Dzierżanowska (Centrum Zdrowia Dziecka)
Jerzy Długoński (Uniwersytet Łódzki) 
Waleria Hryniewicz (Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego)
Józef Kur (Uniwersytet Gdański)
Anna Przondo-Mordarska (Akademia Medyczna we Wrocławiu)

      Redakcja zastrzega sobie możliwość dokonywania skrótów i poprawek nie wpływających na treść pracy. W przypadku konieczności wprowadzenia zmian w treści odsyła się autorowi jeden egzemplarz pracy oraz dyskietkę w celu dokonania poprawek.
      Adresy instytucji, w których pracują autorzy (adres pocztowy oraz e-mail) należy podawać w maszynopisie pracy po piśmiennictwie.
      Prace nie odpowiadające wymaganiom Redakcji będą odsyłane autorom bez rozpatrzenia merytorycznego. W razie nie przyjęcia pracy do druku Redakcja zwraca dyskietkę oraz jeden egzemplarz wydruku, drugi zatrzymuje u siebie. Za datę wpływu przyjmuje się dzień otrzymania pracy w formie zgodnej z instrukcją dla autorów. Autorzy otrzymują bezpłatnie 15 odbitek pracy. Za prace opublikowane w Postępach Mikrobiologii nie przewiduje się honorariów autorskich. Prace należy nadsyłać na adres sekretarza naukowego redakcji:

Dr Bohdan Jerzy Starościak
Zakład Mikrobiologii Farmaceutycznej Akademia Medyczna
ul. Oczki 3 (parter)
02 007 Warszawa
tel. (22) 628-08-22 lub 621-13-51